Posted by on 20 kwietnia 2018

Protokoły badań (dostępne na stronie) zostały zatwierdzone przez instytucjonalną komisję odwoławczą w każdym ośrodku, a wszyscy pacjenci wyrazili pisemną świadomą zgodę przed rejestracją. Populacja badana jest opisana bardziej szczegółowo w dodatkowym dodatku. Metody laboratoryjne
Wszystkie próbki komórek nabłonka oskrzeli zostały przetworzone w celu wyizolowania i analizy RNA pod kątem jakości i wydajności przed analizą ekspresji genów; tylko próbki o wydajności RNA co najmniej .g i dostatecznej integralności RNA były prowadzone na mikromacierzy Gene 1.0 ST. Dalsze szczegóły znajdują się w dodatkowym dodatku. Wszystkie dane z mikromacierzy zostały zdeponowane w bazie danych Gene Expression Omnibus (GEO) pod numerem dostępu GSE66499.
Analiza ekspresji genów
Normalizacja i wstępne przetwarzanie danych z mikromacierzy jest opisane w Dodatku Uzupełniającym. Pacjenci zapisani do AEGIS-1 zostali losowo przydzieleni do niezależnych zestawów treningowych i walidacyjnych (ryc. S1 w Dodatku uzupełniającym). Algorytm klasyfikatora został wyprowadzony tylko w zbiorze szkoleniowym AEGIS-1 i zablokowany, jak opisano wcześniej.13 Wyniki dla każdej próbki w zbiorze sprawdzającym AEGIS-1 i dla wszystkich próbek AEGIS-2 zostały wygenerowane przy użyciu tego predefiniowanego klasyfikatora, który był oparty na ekspresji 23 genów i wieku pacjenta. Te wyniki były dychotomiczne jako pozytywne dla testu i negatywne pod względem testu z zastosowaniem wcześniej określonej wartości progowej.
Analiza statystyczna
Wydajność klasyfikatora została oceniona przy użyciu charakterystyk charakterystyki pracy odbiornika, obliczenia powierzchni pod krzywą (AUC), 14 oraz oszacowań czułości, swoistości, ujemnej wartości predykcyjnej, dodatniej wartości predykcyjnej i ujemnego współczynnika wiarygodności, zdefiniowane jako (1-wrażliwość) ÷ swoistość. Do analizy zmiennych ciągłych zastosowano nieparametryczny test Manna-Whitneya, a dokładny test Fishera zastosowano dla zmiennych jakościowych. Wszystkie przedziały ufności są podawane jako dwumianowe dwumianowe 95% przedziały ufności. Analizę statystyczną przeprowadzono za pomocą oprogramowania R, wersja 3.01 (R Project for Statistical Computing).
Wyniki
Charakterystyka uczestników badania
Tabela 1. Tabela 1. Charakterystyka demograficzna i kliniczna uczestników badania. Łącznie 298 pacjentów z AEGIS-1 zostało włączonych do pierwszego zestawu walidacyjnego, a 341 pacjentów z AEGIS-2 zostało włączonych do drugiego zestawu walidacyjnego (Tabela 1, i Rys. Częstość występowania raka płuca wynosiła odpowiednio 74% i 78% w kohortach AEGIS-1 i AEGIS-2. Pacjenci z rakiem płuca byli starsi i mieli większą skumulowaną ekspozycję na tytoń niż pacjenci bez raka (p <0,001 dla obu porównań) (tabela S3 w dodatkowym dodatku). Podsumowanie stadiów raka i zdiagnozowanych łagodnych stanów przedstawiono odpowiednio w tabelach S4 i S5 w dodatkowym dodatku. Porównania klinicznej charakterystyki 639 pacjentów włączonych do połączonych badań z cechami nieuwzględnionymi (z powodu słabej jakości RNA, utraty do obserwacji lub braku ostatecznej diagnozy po 12 miesiącach) przedstawiono w Tabele S6, S7 i S8 w Dodatku uzupełniającym.
Wykonanie bronchoskopii
Łącznie 639 pacjentów, którzy byli w kohorcie złożonej, przeszło bronchoskopię z podejrzeniem raka płuc
[przypisy: rezonans magnetyczny, porady psychologiczne, diagnoza autyzmu ]

Powiązane tematy z artykułem: diagnoza autyzmu porady psychologiczne rezonans magnetyczny

Posted by on 20 kwietnia 2018

Protokoły badań (dostępne na stronie) zostały zatwierdzone przez instytucjonalną komisję odwoławczą w każdym ośrodku, a wszyscy pacjenci wyrazili pisemną świadomą zgodę przed rejestracją. Populacja badana jest opisana bardziej szczegółowo w dodatkowym dodatku. Metody laboratoryjne
Wszystkie próbki komórek nabłonka oskrzeli zostały przetworzone w celu wyizolowania i analizy RNA pod kątem jakości i wydajności przed analizą ekspresji genów; tylko próbki o wydajności RNA co najmniej .g i dostatecznej integralności RNA były prowadzone na mikromacierzy Gene 1.0 ST. Dalsze szczegóły znajdują się w dodatkowym dodatku. Wszystkie dane z mikromacierzy zostały zdeponowane w bazie danych Gene Expression Omnibus (GEO) pod numerem dostępu GSE66499.
Analiza ekspresji genów
Normalizacja i wstępne przetwarzanie danych z mikromacierzy jest opisane w Dodatku Uzupełniającym. Pacjenci zapisani do AEGIS-1 zostali losowo przydzieleni do niezależnych zestawów treningowych i walidacyjnych (ryc. S1 w Dodatku uzupełniającym). Algorytm klasyfikatora został wyprowadzony tylko w zbiorze szkoleniowym AEGIS-1 i zablokowany, jak opisano wcześniej.13 Wyniki dla każdej próbki w zbiorze sprawdzającym AEGIS-1 i dla wszystkich próbek AEGIS-2 zostały wygenerowane przy użyciu tego predefiniowanego klasyfikatora, który był oparty na ekspresji 23 genów i wieku pacjenta. Te wyniki były dychotomiczne jako pozytywne dla testu i negatywne pod względem testu z zastosowaniem wcześniej określonej wartości progowej.
Analiza statystyczna
Wydajność klasyfikatora została oceniona przy użyciu charakterystyk charakterystyki pracy odbiornika, obliczenia powierzchni pod krzywą (AUC), 14 oraz oszacowań czułości, swoistości, ujemnej wartości predykcyjnej, dodatniej wartości predykcyjnej i ujemnego współczynnika wiarygodności, zdefiniowane jako (1-wrażliwość) ÷ swoistość. Do analizy zmiennych ciągłych zastosowano nieparametryczny test Manna-Whitneya, a dokładny test Fishera zastosowano dla zmiennych jakościowych. Wszystkie przedziały ufności są podawane jako dwumianowe dwumianowe 95% przedziały ufności. Analizę statystyczną przeprowadzono za pomocą oprogramowania R, wersja 3.01 (R Project for Statistical Computing).
Wyniki
Charakterystyka uczestników badania
Tabela 1. Tabela 1. Charakterystyka demograficzna i kliniczna uczestników badania. Łącznie 298 pacjentów z AEGIS-1 zostało włączonych do pierwszego zestawu walidacyjnego, a 341 pacjentów z AEGIS-2 zostało włączonych do drugiego zestawu walidacyjnego (Tabela 1, i Rys. Częstość występowania raka płuca wynosiła odpowiednio 74% i 78% w kohortach AEGIS-1 i AEGIS-2. Pacjenci z rakiem płuca byli starsi i mieli większą skumulowaną ekspozycję na tytoń niż pacjenci bez raka (p <0,001 dla obu porównań) (tabela S3 w dodatkowym dodatku). Podsumowanie stadiów raka i zdiagnozowanych łagodnych stanów przedstawiono odpowiednio w tabelach S4 i S5 w dodatkowym dodatku. Porównania klinicznej charakterystyki 639 pacjentów włączonych do połączonych badań z cechami nieuwzględnionymi (z powodu słabej jakości RNA, utraty do obserwacji lub braku ostatecznej diagnozy po 12 miesiącach) przedstawiono w Tabele S6, S7 i S8 w Dodatku uzupełniającym.
Wykonanie bronchoskopii
Łącznie 639 pacjentów, którzy byli w kohorcie złożonej, przeszło bronchoskopię z podejrzeniem raka płuc
[przypisy: rezonans magnetyczny, porady psychologiczne, diagnoza autyzmu ]

Powiązane tematy z artykułem: diagnoza autyzmu porady psychologiczne rezonans magnetyczny

Posted by on 20 kwietnia 2018

Chirurgiczna biopsja płuc jest jednym podejściem, ale ma współczynnik powikłań około 5% i 30-dniową śmiertelność około 1% .6 Ponadto, 20 do 25% chirurgicznych biopsji wykonuje się u pacjentów, którzy ostatecznie okaże się łagodnymi lesions.7,8 Biopsja przezklatkowa jest również powiązana z dużą zachorowalnością, w tym 15% odma opłucnowa9 i 6% odma opłucnowa wymagająca drenażu w klatce piersiowej.10 Z uwagi na pułapki procedur inwazyjnych, potrzebne są alternatywne podejścia do identyfikacji pacjentów z zmniejszone prawdopodobieństwo raka, którzy są odpowiednimi kandydatami do nadzoru obrazowania. Stosowanie ekspresji genów w klasyfikacji stanów chorobowych w próbkach klinicznych jest dobrze znane.11 Wzory ekspresji genów związane z rakiem występują w cytologicznie prawidłowym nabłonku pobranym z proksymalnych dróg oddechowych obecnych i byłych palaczy z rakiem płuc12. Ostatnio opracowaliśmy klasyfikator ekspresji genów w komórkach nabłonka oskrzeli zebranych z oskrzeli głównej za pomocą bronchoskopii, która odróżnia pacjentów z rakiem płuc od osób bez raka płuc wśród obecnych i byłych palaczy.13 Podjęliśmy obecne badania, aby prospektywnie potwierdzić ten klasyfikator u pacjentów poddanie bronchoskopii podejrzanemu rakowi płuca i ocenę, w jaki sposób ten klasyfikator zmienia diagnostyczną skuteczność bronchoskopii.
Metody
Projekt badania, populacja i protokół
Obecni i byli palacze poddawani bronchoskopii z powodu podejrzenia raka płuca w 28 ośrodkach w Stanach Zjednoczonych, Kanadzie i Irlandii (Tabela S1 w Dodatku uzupełniającym, dostępny wraz z pełnym tekstem tego artykułu) zostali wpisani do genów nabłonka dróg oddechowych w badaniach diagnostycznych raka płuca (AEGIS) (AEGIS-1 i AEGIS-2), dwóch niezależnych, prospektywnych, wieloośrodkowych, obserwacyjnych badaniach. Szczotki cytologiczne zostały użyte do zebrania komórek nabłonka z normalnie wyglądającego oskórka głównego podczas bronchoskopii. Wyniki analizy klasyfikatora nie zostały zgłoszone lekarzom ani pacjentom. Kryteria wykluczenia obejmowały wiek poniżej 21 lat, historię palenia (zdefiniowaną jako kiedykolwiek paląca <100 papierosów) i równoczesny rak lub historię raka płuc.

(więcej…)

Be the first to comment.

Powiązane tematy z artykułem: firma zbrojarska psychiatra poznań Psycholog Wrocław

Posted by on 20 kwietnia 2018

Bronchoskopia jest często niedodiagnostyczna u pacjentów ze zmianami płucnymi podejrzewanymi o raka płuc. Często powoduje to dodatkowe badania inwazyjne, chociaż wiele zmian jest łagodnych. Próbowaliśmy zweryfikować klasyfikator ekspresji genów oskrzeli i dróg oddechowych, który mógłby poprawić diagnostyczną skuteczność bronchoskopii. Metody
Obecni lub byli palacze poddawani bronchoskopii z powodu podejrzenia raka płuca zostali włączeni do 28 ośrodków w dwóch wieloośrodkowych badaniach prospektywnych (AEGIS-1 i AEGIS-2). Klasyfikator ekspresji genu mierzono w komórkach nabłonka zebranych z normalnie wyglądającego głównego oskrzela oskrzelowego, aby ocenić prawdopodobieństwo raka płuc.
Wyniki
Łącznie 639 pacjentów w badaniu AEGIS-1 (298 pacjentów) i badaniu AEGIS-2 (341 pacjentów) spełniło kryteria włączenia. Ogółem 43% badań bronchoskopowych było niediagnostycznych dla raka płuc, a zabiegi inwazyjne przeprowadzono po bronchoskopii u 35% pacjentów z łagodnymi zmianami.

(więcej…)

Be the first to comment.

Powiązane tematy z artykułem: autyzm terapia firma zbrojarska psycholog poznań